Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nav1Q8CH77 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nav1Q8CH77 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nav1Q8CH77 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nav1Q8CH77 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nav1Q8CH77 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms