Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rp1l1Q8CGM2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rp1l1Q8CGM2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rp1l1Q8CGM2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms