Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klf17Q8CFA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klf17Q8CFA7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms