Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdkl1Q8CEQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms