Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc63Q8CDV6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc63Q8CDV6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc63Q8CDV6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc63Q8CDV6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 315.2 ms