Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Riox2Q8CD15 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Riox2Q8CD15 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Riox2Q8CD15 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Riox2Q8CD15 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms