Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ufl1Q8CCJ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ufl1Q8CCJ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ufl1Q8CCJ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ufl1Q8CCJ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms