Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
E4f1Q8CCE9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E4f1Q8CCE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E4f1Q8CCE9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E4f1Q8CCE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms