Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8C708 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C708 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms