Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C708 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C708 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C708 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q8C708 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q8C708 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q8C708 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q8C708 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q8C708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q8C708 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q8C708 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q8C708 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q8C708 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q8C708 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q8C708 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms