Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5W0

Clmn, Calmin, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmnQ8C5W0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ClmnQ8C5W0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ClmnQ8C5W0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ClmnQ8C5W0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms