Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa22Q8C1N8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa22Q8C1N8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms