Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Iffo1Q8BXL9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Iffo1Q8BXL9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Iffo1Q8BXL9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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