Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kdm4aQ8BW72 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4aQ8BW72 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4aQ8BW72 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms