Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scfd2Q8BTY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scfd2Q8BTY8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scfd2Q8BTY8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scfd2Q8BTY8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.8 ms