Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppfia2Q8BSS9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfia2Q8BSS9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfia2Q8BSS9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms