Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rd3Q8BRE0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3Q8BRE0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3Q8BRE0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rd3Q8BRE0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms