Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E130116L18RikQ8BMV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
E130116L18RikQ8BMV6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
E130116L18RikQ8BMV6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.5 ms