Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp1Q8BJQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp1Q8BJQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp1Q8BJQ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms