Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcal1Q8BJL0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarcal1Q8BJL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms