Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rufy1Q8BIJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rufy1Q8BIJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms