Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdca8Q8BHX3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdca8Q8BHX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdca8Q8BHX3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdca8Q8BHX3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms