Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmco3Q8BH01 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmco3Q8BH01 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmco3Q8BH01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmco3Q8BH01 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms