Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vipas39Q8BGQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vipas39Q8BGQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vipas39Q8BGQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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