Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best2Q8BGM5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best2Q8BGM5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best2Q8BGM5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms