Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG2

Gm5148, Predicted gene 5148, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5148Q8BGG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5148Q8BGG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm5148Q8BGG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm5148Q8BGG2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5148Q8BGG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5148Q8BGG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm5148Q8BGG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm5148Q8BGG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5148Q8BGG2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms