Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm3Q80WV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Srrm3Q80WV7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Srrm3Q80WV7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Srrm3Q80WV7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms