Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc1Q80VQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc1Q80VQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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