Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR4

Slit1, Slit homolog 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit1Q80TR4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slit1Q80TR4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Slit1Q80TR4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slit1Q80TR4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Slit1Q80TR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slit1Q80TR4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms