Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sgo2Q7TSY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sgo2Q7TSY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sgo2Q7TSY8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgo2Q7TSY8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgo2Q7TSY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sgo2Q7TSY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms