Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ube2q1Q7TSS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ube2q1Q7TSS2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ube2q1Q7TSS2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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