Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccp110Q7TSH4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccp110Q7TSH4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccp110Q7TSH4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccp110Q7TSH4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms