Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1bQ7TSF1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1bQ7TSF1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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