Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tubb2aQ7TMM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tubb2aQ7TMM9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tubb2aQ7TMM9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tubb2aQ7TMM9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms