Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ScocQ78YZ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ScocQ78YZ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ScocQ78YZ6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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