Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcl2Q78Y63 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcl2Q78Y63 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcl2Q78Y63 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdcl2Q78Y63 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms