Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl35Q6ZWV7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl35Q6ZWV7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl35Q6ZWV7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms