Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SpopQ6ZWS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpopQ6ZWS8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpopQ6ZWS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SpopQ6ZWS8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms