Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc44a1Q6X893 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc44a1Q6X893 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Slc44a1Q6X893 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc44a1Q6X893 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms