Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Opn5Q6VZZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Opn5Q6VZZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Opn5Q6VZZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn5Q6VZZ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn5Q6VZZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn5Q6VZZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn5Q6VZZ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Opn5Q6VZZ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms