Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Rhox8Q6VSS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Rhox8Q6VSS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rhox8Q6VSS7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rhox8Q6VSS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rhox8Q6VSS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Rhox8Q6VSS7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Rhox8Q6VSS7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms