Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nup98Q6PFD9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nup98Q6PFD9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup98Q6PFD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nup98Q6PFD9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup98Q6PFD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms