Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gramd2bQ6PEM6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gramd2bQ6PEM6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gramd2bQ6PEM6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gramd2bQ6PEM6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms