Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vstm2lQ6PDS0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vstm2lQ6PDS0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vstm2lQ6PDS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms