Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Trak1Q6PD31 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Trak1Q6PD31 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Trak1Q6PD31 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Trak1Q6PD31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Trak1Q6PD31 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms