Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim37Q6PCX9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim37Q6PCX9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim37Q6PCX9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim37Q6PCX9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms