Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB44

Ptpn23, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23, mousemouse

Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn23Q6PB44 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ptpn23Q6PB44 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ptpn23Q6PB44 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ptpn23Q6PB44 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ptpn23Q6PB44 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptpn23Q6PB44 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms