Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Prkab2Q6PAM0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prkab2Q6PAM0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Prkab2Q6PAM0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Prkab2Q6PAM0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms