Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BC061212Q6P8K3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BC061212Q6P8K3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BC061212Q6P8K3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms