Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nwd2Q6P5U7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nwd2Q6P5U7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nwd2Q6P5U7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nwd2Q6P5U7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nwd2Q6P5U7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms