Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atg2aQ6P4T0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg2aQ6P4T0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg2aQ6P4T0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atg2aQ6P4T0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms